单细胞测序在骨科研究中有哪些新进展?

单细胞测序(single cell sequencing)是在单个细胞水平上,对基因组或转录组进行扩增并测序,以检测单核苷酸位点变异(SNV)、基因拷贝数变异(CNV)、单细胞基因组结构变异、基因表达水平、基因融合、单细胞转录组的选择性剪切、单细胞表观基因组的DNA甲基化状态等。

单细胞测序技术自从2009年首次问世,在这十几年以来持续不断地发展。尤其是近几年,单细胞测序出现了爆发式的发展和普及。2011年,《Nature Methods》杂志将单细胞研究方法列为未来几年最值得关注的技术领域之一。2013年,《Science》杂志将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,《Nature Methods》杂志将单细胞测序的应用列为2013年年度最重要的方法学进展。2017年10月16日,与“人类基因组计划”相媲美的“人类细胞图谱计划”首批拟资助的38个项目正式公布,引爆单细胞测序新时代。

目前单细胞测序主要集中在新冠病毒及癌症的研究,在其他领域的研究较少。



论文分析

检索数据库:Medline
检索工具:文献鸟/PubMed
检索时间:May 21, 2022
检索词:(Single cell sequencing) AND (Orthopaed*[Affiliation] OR orthoped*[Affiliation]) NOT "Zhongguo Gu Shang"[Journal] NOT "Zhongguo Xiu Fu Chong Jian Wai Ke Za Zhi"[Journal]


单细胞测序在骨科应用领域研究论文发表的时间和国家分布


全球单细胞测序在骨科应用领域研究仅发表了702篇Medline收录的文献;文献鸟对其进行了分析。


国家分布可以看到,美国发表的研究论文数量为274篇,文章数占总量的40%;中国发表的文章数为258篇,占37%,排在第二位;日本、德国和英国分列第三到五名。

学术机构排名

英国牛津大学、中国浙江大学、中国郑州大学第一附属医院、美国华盛顿大学医学院、中国中南大学、中国香港中文大学、中国南方医科大学、中国同济大学、中国上海交通大学、美国约翰斯·霍普金斯大学等发表的论文较多。

发表的期刊

从全球看,发表单细胞测序在骨科应用稿件数量较多的期刊有Nat Commun (IF:14.9)、Sci Rep (IF:4.4)、Front Immunol (IF: 7.6)、Front Cell Dev Biol (IF: 6.7)、PLoS One (IF: 3.2)等。

关注的疾病

从全球看,发表单细胞测序在骨科应用的稿件主要关注骨关节炎、关节炎、脊柱侧弯、类风湿关节炎、脊髓损伤等疾病。

最活跃的学者

美国西雅图儿童医院Beier, David R教授,美国波士顿儿童医院Smits, Patrick教授,中国北京大学Zhang, Zemin教授,魏茨曼科学研究所Ledergor, Guy 教授,美国马萨诸塞州总医院Kobayashi, Tatsuya教授,美国斯坦福大学Jerby-Arnon, Livnat教授在单细胞测序在骨科应用研究领域最为活跃。

此分析不足之处:

如果拼写不同,数据库会将同一单位,同一基金等按照两个不同单位处理。

由于检索的局限性,数据分析很可能存在不当之处;请各位专家指正。



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