Cell子刊新发现：肠菌藏身"安全屋"躲避抗生素
02月21日的《热心肠日报》，我们解读了 15 篇文献，关注：抗生素耐受，癌症免疫治疗，肥胖相关大肠癌，肠道病原体，儿童，肠道免疫，HIV感染，同性性行为，信诺维，奥马珠单抗，艾益生物药品，君恒医药，三鑫医疗。
该篇日报由R·AI辅助创作生成，人工审核校对。
Cell子刊：另辟蹊径——肠菌躲过抗生素的新策略
Cell Host and Microbe——[30.3]
① 开发一种更接近人类抗生素药代动力学的小鼠模型：基因条形码标记的抗生素敏感大肠杆菌定植无菌小鼠，并通过可操作皮下泵施用头孢吡肟，从而更好地了解肠道细菌对抗生素的反应；② 在头孢吡肟浓度仍具有抑制作用的小鼠肠道组织中，可分离到大肠杆菌；③ 部分大肠杆菌分离株通过突变多糖荚膜合成相关基因，增强其在肠道细胞中的侵袭入和存活；④ 这些突变株进一步暴露于头孢吡肟仍可持久存活；⑤ 荚膜多糖合成基因wbaP敲除菌株具有以上表型，且对结肠细胞的侵袭增加；⑥ 本研究揭示了一种细菌不发生耐药性，但可逃避抗生素治疗并在哺乳动物肠道中生存的新机制。
【原文信息】
Susceptible bacteria "can" survive antibiotic treatment in the mammalian gastrointestinal tract without evolving resistance
2024-02-14 , doi: 10.1016/j.chom.2024.01.012
Nature子刊：纵向分析菌群变化，揭示与癌症免疫治疗长期疗效相关的肠菌特征
Nature Medicine——[82.9]
① 通过对175名接受免疫检查点阻断（ICB）治疗的晚期黑色素瘤患者进行纵向的基于物种基因组分箱（SGBs）的肠道微生物组分析，研究揭示出与治疗效果相关的微生物组变化，为指导通过调控微生物组以增强ICB疗效提供了重要参考；② 在实现12个月或更长无进展生存期（PFS≥12）的患者与PFS小于12个月（PFS <12）的患者之间，发现了99个SGB有不同的表达模式，其中20个SGB丰度在基线时差异显著，42个SGB仅在治疗后差异显著；③ 识别出5个SGB在PFS≥12的患者中持续高表达，而4个SGB在PFS<12的患者中持续高表达；④ 通过构建这些SGB的对数比值，发现其与总生存期有关联；⑤ 不同的临床情境下存在不同的微生物组动态，包括ICB方案类型、免疫相关不良事件的发展以及合并用药情况。
【原文信息】
Longitudinal gut microbiome changes in immune checkpoint blockade-treated advanced melanoma
2024-02-16 , doi: 10.1038/s41591-024-02803-3
马延磊团队Cell子刊：揭示肥胖相关大肠癌的菌群和代谢特征，菌间互作为肿瘤发生提供新线索
Cell Reports Medicine——[14.3]
① 复旦大学附属肿瘤医院马延磊团队通过对522例不同体重组的结直肠癌（CRC）患者与健康人粪便样品进行宏基因组测序和代谢组学分析，揭示了肥胖相关CRC的特征；② 肥胖相关CRC患者的肠道微生物组成存在明显差异，口炎消化链球菌（Ps）丰度升高，脂肪酸和磷脂代谢失调，涉及甘油磷脂代谢和脂多糖合成的KEGG通路发生改变；③ 相关性分析揭示了肥胖状态下微生物间的相互作用，其中有益菌普氏粪杆菌和肿瘤富集菌Ps可能存在互养作用，从而促进肿瘤发生，体外实验证实了二者间的互养关系，这种共生微生物间的相互作用可能是肥胖与CRC风险增加之间关联的重要因素；④ 构建了基于体重指数（BMI）分类的微生物标志物的诊断模型，显示了在特定BMI组中对CRC诊断的稳健性及其作为精准诊断工具的潜在用途。
【原文信息】
Microbial and metabolic profiles unveil mutualistic microbe-microbe interaction in obesity-related colorectal cancer
2024-02-19 , doi: 10.1016/j.xcrm.2024.101429
Lancet子刊：抗生素耐药沙门氏菌在75个国家的流行病学研究
The Lancet Global Health——[34.3]
① 采用贝叶斯时空建模，对1990至2019年75个国家痢疾流行的Typhi和Paratyphi A的抗生素抗性进行研究，以揭示抗性水平演变趋势；② 在南亚和东南亚，多重耐药（MDR）S Typhi流行下降，而在非洲撒哈拉以南，MDR S Typhi总体流行率从1990年的6.0%增至2019年的72.7%；③ 氟喹诺酮非敏感性（FQNS）S Typhi自1990年以来在南亚急剧增加，达到95.2%，对应全球250万MDR S Typhi感染和740万FQNS S Typhi感染；④ 尽管整个流行区域中第三代头孢菌素抗性S Typhi相对较低，但2019年巴基斯坦抗性率达到61.0%；⑤ 本研究强调了在过去30年中S Typhi和S Paratyphi A感染中MDR、FQNS和第三代头孢菌素抗性水平的增加，为公共卫生干预提供了重要依据。
【原文信息】
Estimating the subnational prevalence of antimicrobial resistant Salmonella enterica serovars Typhi and Paratyphi A infections in 75 endemic countries, 1990-2019: a modelling study
2024-03-01 , doi: 10.1016/S2214-109X(23)00585-5
婴儿早期使用青霉素和庆大霉素导致肠道抗药基因持续增加
Microbiome——[15.5]
① 纳入45名婴儿从出生到2岁期间的208个样本，纵向分析早期抗生素暴露及分娩方式对婴儿肠道菌群和耐药基因组的影响；② 与出生时相比，2岁时婴儿肠道菌群组成更为多样且稳定；③ 剖宫产/出生后4天内接受抗生素治疗的婴儿，其肠道中变形菌门比例显著高，而阴道分娩未接触抗生素的婴儿中阿克曼菌门和拟杆菌门的相对丰度更高；④ 婴儿肠道中双歧杆菌和拟杆菌门持续稳定定植；⑤ 抗生素暴露导致变形菌门和厚壁菌门中携带多重耐药基因的频率增加；⑥ 本研究揭示了抗生素暴露对婴儿肠道菌群多样性和耐药性的持久性改变。
【原文信息】
Early life exposure of infants to benzylpenicillin and gentamicin is associated with a persistent amplification of the gut resistome
2024-02-03 , doi: 10.1186/s40168-023-01732-6
Lancet子刊：预防儿童生长迟缓，不能忽视环境病原体
The Lancet Global Health——[34.3]
① 通过对个体参与者数据荟萃分析，旨在评估肠道病原体和人畜粪便标记物检测与儿童随后的肠道感染和生长发育间的关联；② 环境中病原体与儿童感染同一病原体的发生率增加及身高年龄Z分数（HAZ）降低有关，但与腹泻无直接关联，除非在潮湿季节；③ 环境中检测到的人畜粪便标记物与腹泻和HAZ间没有显著关联；④ 土壤、儿童手部和储存的饮用水被认为是主要的传播途径；⑤ 研究结果支持从环境中的病原体到感染再到生长迟缓的因果链条，表明水源、公共和个人卫生干预措施对儿童生长的影响有限可能源于环境中病原体减少不足。
【原文信息】
Is detection of enteropathogens and human or animal faecal markers in the environment associated with subsequent child enteric infections and growth: an individual participant data meta-analysis
2024-03-01 , doi: 10.1016/S2214-109X(23)00563-6
肠道免疫新发现：TNF-IL-1如何协同控制耶尔森菌感染？
Journal of Experimental Medicine——[15.3]
① 假结核耶尔森菌常定植于肠粘膜，会诱导中性粒细胞和炎症单核细胞的招募，形成被称为脓肉芽肿的有组织免疫结构，以控制假结核耶尔森菌感染；② 通过对肠道耶尔森氏菌感染研究，发现炎症单核细胞中的TNF信号对于耶尔森菌感染后的细菌限制至关重要；③ 单核细胞内在的TNFR1信号驱动单核细胞源性白细胞介素-1产生，IL-1通过非造血细胞上的IL-1受体信号传导，从而使肠道假结核耶尔森菌感染得以通过脓肉芽肿控制；④ 本研究揭示了一种单核细胞内在的TNF-IL-1协同炎症回路，限制肠道假结核耶尔森菌感染。
【原文信息】
A TNF-IL-1 circuit controls Yersinia within intestinal pyogranulomas
2024-02-16 , doi: 10.1084/jem.20230679
Nature子刊：HIV相关肠菌的改变依赖于宿主和地理环境
Nature Communications——[16.6]
① 为更好地了解HIV对全球粪便菌群的影响，比较了美国、乌干达和博茨瓦纳个体的粪便微生物群落；② 无论接受治疗与否，HIV感染都会导致显著的细菌分类群变化，并且每个队列中都具有很高的独特性；③ HIV相关的细菌群落变化在报告有男男性行为（MSM）的人群和非MSM人群之间也存在显著差异；④ 尽管HIV感染一致地与更高的可溶性免疫激活标志物相关，但与这些标志物相关的特定细菌群在每个地区都不相同，且没有一个细菌群在所有三个地理位置中共享；⑤ 本研究强调在不同地理位置和性行为群体中，HIV相关的肠道菌群变化总体上是独特的，尽管少数几种在两个地理位置间共享的细菌群值得进一步研究。
【原文信息】
HIV-associated gut microbial alterations are dependent on host and geographic context
2024-02-05 , doi: 10.1038/s41467-023-44566-4
从免疫和肠菌视角，看抗HIV治疗效果的城乡差异
Microbiome——[15.5]
① 在津巴布韦的城市及农村HIV感染者中，抗逆转录病毒治疗（ART）对免疫反应和肠道菌群的影响存在差异；② ART显著降低炎症标志物IL-6、T细胞活化和耗竭水平，这些变化在城市地区比农村地区更明显；③ ART治疗的HIV感染者的肠道菌群组成与健康对照相比变化很大，表现为α多样性降低和菌群组成改变；④ 未经治疗的HIV感染者的肠道菌群与T细胞活化和耗竭密切相关，提示肠道菌群在未控制感染的疾病进展中扮演重要角色；⑤ ART治疗24周后的免疫耗竭与农村生活及普氏菌属富集/拟杆菌属缺失的肠道菌群特征相关；⑥ 研究结果表明，相比于城市，ART治疗对农村HIV感染者的炎症及T细胞活化降低较少。
【原文信息】
Differential effects of antiretroviral treatment on immunity and gut microbiome composition in people living with HIV in rural versus urban Zimbabwe
2024-02-03 , doi: 10.1186/s40168-023-01718-4
Cell子刊：同性性行为与肠道菌群的非西方化相关
Cell Reports Medicine——[14.3]
① 纳入93名男男性行为者（MSM）和31名非MSM受试者，采集粪便进行鸟枪法宏基因组测序，从物种水平上描述其肠道菌群特征；② 许多西方背景MSM的肠道微生物组类似于非西方化人群的肠道微生物社区，通常由普雷沃氏菌科成员主导，包括Segatella copri复合体和未知Prevotellaceae成员的共同定植；③ 通过问卷分析探索MSM间的个体差异，可将特定性行为与微生物组成相联系；④ 通过机器学习可识别出与MSM性行为相关的肠道菌群特征，该研究表明MSM性行为与其肠道菌群变化有关。
【原文信息】
Establishment of a non-Westernized gut microbiota in men who have sex with men is associated with sexual practices
2024-02-08 , doi: 10.1016/j.xcrm.2024.101426
信诺维完成7亿元E轮融资，腾讯投资、国鑫投资联合领投
① 2月20日，信诺维于宣布，完成7亿元E轮融资，由腾讯投资和国鑫投资联合领投；② 本轮融资还得到了济南产发、华控投资等多家机构的支持，老股东正心谷资本也持续支持；③ 募集资金将用于推进多条管线的临床试验，完善自主创新的靶向治疗、抗感染和蛋白降解靶向嵌合体三大技术平台，加速生产基地运营以及商业化团队建设，推动产品早日上市；④ 信诺维已开发了包括BLI抑制剂、EZH2抑制剂、hURAT1抑制剂以及新一代抗体偶联药物（ADC）等在内的创新药管线，覆盖肿瘤、多重耐药菌感染和代谢等疾病领域，目前有9个产品处于临床研发阶段；⑤ 其中2款产品已进入3期临床，包括信诺维研发的新一代β-内酰胺酶类广谱抗耐药菌药物XNW4107。
【原文信息】
信诺维完成7亿元E轮融资，腾讯投资、国鑫投资联合领投！
2024-02-20 , 医药观澜
罗氏「奥马珠单抗」新适应证获批，治疗多种食物过敏
① 2月16日，罗氏宣布奥马珠单抗（Xolair）的补充生物制剂许可申请（sBLA）获FDA批准；② 可用于成人和1岁以上儿童因意外暴露于一种或多种食物而可能发生IgE介导的过敏反应，推荐剂量为75mg至600mg，每2或4周一次；③ 该药物是FDA批准的首款也是唯一一款用于减少一种或多种食物过敏反应的药物；④ 此次获批是基于3期OUtMATCH的阳性研究结果，结果显示，奥马珠单抗治疗可显著提高患者对花生和其他常见食物的过敏阈值；⑤ 奥马珠单抗是一款采用基因重组技术以中国仓鼠卵巢细胞生产的人IgE人源化单克隆抗体。
【原文信息】
首款！奥马珠单抗新适应症获批，治疗多种食物过敏
2024-02-17 , 医药魔方Info
艾益动物药品完成数亿元C轮融资
① 2月20日，苏州艾益动物药品有限公司完成数亿元人民币的C轮融资；② 本轮融资由元希海河基金、松青申汇嘉瑞基金联合领投，多家机构跟投；③ 融资包括股权和十年期债权融资，易凯资本担任独家财务顾问；④ 艾益动物药品是中国领先的宠物疫苗企业，致力于研发、注册与生产国际一流品控的宠物疫苗。
【原文信息】
艾益动物药品完成数亿元C轮融资
2024-02-20 , 动脉网
中药CXO企业「君恒医药」完成数千万元天使轮融资
① 近日，杭州君恒制药有限公司完成数千万元天使轮融资；② 本轮融资由华方资本独家出资；③ 将用于推进基于质量标志物的创新中药开发平台建设和人才队伍扩充；④ 君恒医药依托独特的质量标志物活性追踪平台和多靶标药效筛选平台，提供一站式中药CRO服务；⑤ 近年来中药领域呈现出井喷式的发展态势，君恒医药已成为上海市生物医药研发与转化功能型平台单位，具有明显技术优势和发展后劲。
【原文信息】
君恒医药完成数千万元天使轮融资，推进基于质量标志物的创新中药开发
2024-02-18 , 动脉网
三鑫医疗子公司肠道水疗机获医疗器械注册证
① 2月19日，江西三鑫医疗发布公告称，旗下全资子公司江西圣丹康医学科技开发的肠道水疗机，取得了江西省药品监督管理局颁发的《医疗器械注册证》；② 该设备可以实现高位结肠清洗，能精准控制液体流量，具备温度、压力实时反馈功能，可提高治疗过程患者体验感和医护人员操作便捷度；③ 该设备主要由电路控制系统和液路系统两部分组成，具备自检、待机、排空、冲洗、消毒、水疗的临床功能；④ 江西圣丹康专业从事慢性肾病医疗装备、中药结肠透析、中药与器械结合等相关产品的研发及医疗器械产品的销售和服务。
【原文信息】
三鑫医疗:关于全资子公司获得肠道水疗机医疗器械注册证的公告
2024-02-19 , 东方财富网
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