11月8日，在相关通知发布8个多月后，国家卫生健康委员会内设机构调整在官网上正式更新，医政医管局更名为医政司，卫生应急办公室更名为医疗应急司，原机关党委更名为机关党委，撤销国家卫健委疾病预防控制局、综合监督局。
2021年 6月2日凌晨，国家呼吸医学中心、广州实验室指导金域医学等单位共建的四组“猎鹰”气膜方舱实验室在广州体育馆初步搭建完成，于3日正式开始核酸检测，这是自2020年新冠肺炎疫情发生以来广东首次投入使用方舱实验室。
2月16日，中国机构编制网发布了《中共中央办公厅 国务院办公厅关于调整国家卫生健康委员会职能配置、内设机构和人员编制的通知》，宣布将国家卫健委下设的医政医管局更名为医政司，卫生应急办公室更名为医疗应急司，同时撤销疾病预防控制局、综合监督局。
