头孢呋辛酯和头孢克肟都属于头孢菌素类的抗菌药物，但不同的是，头孢呋辛属于第二代头孢菌素，头孢克肟属于第三代头孢菌素，总体来说，对革兰阳性菌的抗菌活性，二代头孢菌素要优于三代头孢菌素，而对于革兰阴性菌的抗菌作用，三代头孢菌素要强于二代头孢菌素，二代头孢菌素口服品种主要包括头孢呋辛，头孢克洛 ，头孢丙烯，三代头孢菌素的口服品种主要包括头孢克肟，头孢地尼等，两大类头孢菌素因抗菌谱不同，在适应症方面也有所区别。
