其实方法挺多。
首先说说原剧情中实际发生的。
方法一，eva对战eva即可，比如三号机被使徒侵蚀以后，初号机被强制使用傀儡系统，然后把三号机拆了，驾驶员重伤。
方法二，由nerv总部下令，增加驾驶舱里lcl浓度，驾驶员昏迷，然后想办法回收机体即可。同样是三号机被使徒侵蚀那次，真嗣后来要拆总部，司令直接把真嗣弄昏迷了。
方法三，请seele出手，上eva量产机。比如旧剧场版里二号机最后被量产机给拆了，驾驶员当然就随意处置了。
接下来说说其他动漫里的能力。
哆啦A梦的任意门，武斗系里徒手拆高达的各路猛男比如琦玉老师或者七龙珠孙悟空之类的，然后一本黑色封面的小本本也可以。
那么多加一点限制条件，非nerv，使用人类现有科技，eva也不能无限制暴走，也不能一言不合就引发冲击，能不能做到？一样是可以。
eva对空能力极差，而且电源线也没有at力场，直接让人类空军从空中切断电源线，然后熬过五分钟，eva就停电了。。。剩下的就随便了。
所以，想杀掉或者逮捕一名在eva里的驾驶员，真心不是多困难的事情。