巴拿马运河两边存在海平面高度差，通过修建船闸来调节水位解决这一问题。
船闸的工作原理是通过控制水的流动来改变水位。当船只接近船闸时，会先停靠在入口处，随后关闭或打开闸门，让水流入或排出船闸，从而调整水位。具体过程如下：船只进入船闸后，闸门关闭，然后根据目标水位的需求，将水注入或排出船闸。随着水位的上升或下降，船只也随之平稳地上升或下降，最终到达下一个航道段。
巴拿马运河设有多道船闸，通过这些船闸的分级调节，可以有效减小两边海平面高度差带来的影响，使得船只能够安全、顺利地通过运河。尽管存在海平面高度差，但借助船闸系统，巴拿马运河依然能够发挥重要的航运作用，成为连接太平洋和大西洋的重要水上通道。
