乾隆二十四年(1759年),清军彻底平定大小和卓之乱,天山南北纳入大清帝国版图。由于此前准噶尔汗国经常性的降而复叛,再加上天山以南的和卓残余势力依旧存在。于是,乾隆决定在新疆实行军政一体的伊犁将军管辖体制,并从内地和东北、蒙古等地抽调精锐到新疆驻防。