今天早上7点多早高峰期间，南京地铁1号线因天隆寺联锁区发生信号故障，造成多列车临时停运、行车间隔拉长。列车在通过故障区段时采用手动驾驶模式。不少乘客表示故障发生时列车停在两站区间轨道内，并等待数十分钟，沿线各站台更挤满了排队乘客。
根据疫情防控工作需要，经南京市新型冠状病毒肺炎疫情联防联控工作指挥部批准，自 2021 年 8 月 3 日起，南京地铁将对 1 号线、3 号线、S8 号线运营区段进行调整，具体如下:1、1 号线运营区段调整为迈皋桥站至南京南站，双龙大道站至中国药科大学站临时关闭。具体恢复时间另行公布，请留意南京地铁官方微博、车站告示。
根据地铁建设计划，在建1号线北延线工程即将接入既有1号线迈皋桥站。受新建线路割接施工影响，地铁1号线迈皋桥站、红山动物园站将于8月12日至8月16日临时停止运营服务，1号线中国药科大学至南京站区段的行车组织将配合调整。
地铁1号线北延线割接施工如期完成，8月17日起1号线全线恢复正常运营。南京地铁1号线北延线割接施工如期完成，自2022年8月17日起，地铁1号线迈皋桥站、红山动物园站恢复正常运营，1号线自首班车起恢复中国药科大学站至迈皋桥站、河定桥站至迈皋桥站大小交路运行。
交汇点讯 3月16日（周日）上午，2025年南京半程马拉松将正式开跑，南京地铁制定保障方案，为参赛选手及乘客提供便捷出行服务。当天，地铁1、2、3、4、10号线提前至5:30运营，其余线路维持正常运营时间。
8月19日，南京全域转为低风险。8月20日起，南京江宁区停运的地铁、公交线路恢复运行。记者一早来到百家湖站，体验地铁1号线恢复全线运行以来的首班车以及早高峰的客流情况。【清晨五点半出发 早班车上已有少数乘客】南京地铁一号线百家湖站，清晨5:30。
27日夜，南京市栖霞区发布关于进一步强化区域疫情防控措施的通告，为迅速阻断铁路货运尧化门站货场疫情传播链条，尽快实现社会面清零，划定临时管控区域，实施时间为2022年10月28日零时起，11月2日零时止。
9月16日，南京地铁全线地面以及高架区段停运。同时，长三角铁路部分旅客列车将采取临时停运措施。江苏台记者董雯：“受台风‘贝碧嘉’影响，为了保障地铁的运营安全，从今天中午12点起，南京地铁全线往地面以及高架区段停运。
受台风“贝碧嘉”影响，为保障地铁运营安全，自9月16日12:00起，南京地铁全线网地面及高架区段停运，具体运营组织安排如下：停运区段的恢复时间将根据台风影响情况确定，届时将第一时间通过官方微博及官方APP “与宁同行”发布公告，请乘客关注天气情况及地铁运营信息。
